医院拥有国家临床重点专科建设项目2个：重症医学科、普外科；国家中医药管理局重点学科1个：中医痹病学；安徽省“十三五”临床重点专科8个：医学影像学科、骨科、血液内科、妇产科、重症医学科、神经外科、普外科、麻醉科；“十四五”临床重点专科5个：重症医学科、心血管内科、内分泌科、泌尿外科、神经内科。

有重大疾病非编码RNA转化研究安徽省普通高校重点实验室、安徽省危重症（呼吸）临床医学研究中心、国家老年疾病临床医学研究中心安徽分中心、国家神经系统疾病临床医学研究中心安徽区域分中心等省部级科研平台。